Narodowe Laboratorium Wody ujawniło, że ze względu na stężenie bakterii coli w fekaliach na kilku plażach Kostaryki przewyższony jest akceptowalny poziom 240 bakterii coli na 100 ml wody. Największe stężenie zanotowano w prowincji Limon na plaży Portete, gdzie stwierdzono 7.000 kałowych bakterii coli na 100 ml. Po stronie pacyficznej u ujścia rzeki Tarcoles niebezpieczny poziom wykazywały plaże Azul, Tarcoles oraz odcinek wybrzeża przy Quepos. Podobnie ma się z południowym krańcem Playas del Coco.

Podkreśla się, że najbardziej skażone są plaże u ujść rzek, m.in. Jaco i Cahuita. Dla osób pływających w wodach przy takich plażach częste są zapalenia spojówek, podrażnienia skóry oraz biegunki. Kostarykańskie plaże podzielone są na 5 kategorii pod względem czystości wód: niebieska (najwyższa jakość) mniej niż 10 bakterii coli na 100 ml wody, zielona (dobra jakość) 10-100, żółta (prawidłowa jakość) 101-240, czerwona (niezalecana do pływania) 240-500 i brązowa (skażona, nienadająca się do pływania) 500-1.000. Plaże z kategorią niebieska to Playa Blanca, Langosta, Puerto Vargas, Conchal, Flamingo. Brązowe to Quepos, Tarcoles, Azul, Golfito i Guacalillo.